В БГУ 2.0 в типовом отчете "Реестр документов, подтверждающих обоснованность применения налоговых льгот" нет автоматического заполнения, я исправил этот недостаток и сделал автоматическое заполнение. Если у вас всего один код операций, то можно сформировать и заполнить код можно в последнюю очередь в уже сформированном дереве документов (как и ВидОперации).
Доделанный отчет из публикации //infostart.ru/public/1422559. Добавлен в заполнении фильтр по организации. Упорядочена при заполнении подчиненность дерева Договор/Контрагент/Документ. Дозаполнены реквизиты. Оформлено в виде расширения.
Тестировалось на релизе БГУ 2.0.82.11.